未经腐熟的生物有机肥中，携带有大量的致病微生物和寄生性蛔虫卵，施入农田后，一部分附着在作物上造成直接污染，一部分进入土壤会造成间接污染。若有机肥未完全腐熟施用至田间后,会继续进行有机肥发酵,造成土壤温度升高,且易产生有害气体及物质累积于土壤当中,造成作物根部的伤害。生物有机肥经过完成腐熟,由于处理过程有机肥物料得到了彻底的腐熟,施到地里不会产生二次有机肥发酵,不会因发生二次发酵中快速繁殖的微生物和作物根系争氧而产生烧根烧苗现象，使用非常安全。

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